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常规赛
常规赛进行单循环制，每支俱乐部将分别与其他11家俱乐部进行依次对抗。
常规赛阶段采用三局两胜制（BO3），比赛顺序为先进行一场1v1,再进行一场3v3,再进行一场1v1,两场1v1不得使用同一名选手参赛，先赢得两场比赛的俱乐部获胜。
常规赛阶段，各俱乐部每轮比赛前必须填写《FIFA ONLINE 3职业联赛登场选手确认表》报名该轮上场选手，由领队交由赛会裁判长，每队每轮最多报4名选手！表单应在每个比赛日当日0点前以邮件形式交由主办方，一旦提交后不能更改。
常规赛共11轮比赛，从2016年5月7日、8日开始，前四周每周两个比赛日（周六、周日），每日进行一轮。6月3日、4日、5日（周五、周六、周日）完成常规赛的最后三轮比赛，一共66场比赛。
常规赛结束时位列积分榜前6名的俱乐部晋级季后赛常规赛最后两名的俱乐部将与次级联赛的前两名参加TGA争夺下一赛季职业联赛参赛资格。
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季后赛
在季后赛阶段的所有比赛均采用五局三胜制（BO5），顺序为1v1,3v3,1v1,3v3,1v1,率先赢得三局比赛的俱乐部获胜。
季后赛阶段对每家俱乐部的上场选手没有人数要求，但每名选手每场比赛最多参加一局1v1比赛。
季后赛将于2016年6月11日和6月12日两天进行，常规赛的前两名轮空，剩下四支俱乐部根据常规赛排名以第三对第六，第四对第五的方式 决出两个晋级名额，与轮空的常规赛前两名组成最终的四强。
2016年6月12日，抽签决定四强对阵，胜者进入四强，决定最终冠军。冠军俱乐部将拥有代表中国参加后续洲际赛事的优先权利。
